계정별원장은 보통 ‘원장’으로 부르는 것으로, 사용자가 입력한 거래에 사용된 모든 계정과목 중에서 지정한 계정과목을 날짜별로 거래적요와 함께 보고서로 출력한다. 결산을 하면 모든 계정과목에 대한 원장을 출력, 보관하고 있어야 한다.
[계정별원장]은 [계정과목명세서]와 형태가 거의 비슷한데 차이점은 계정별원장은 이월기초잔액 부터 시작하여 잔액을 추적하고, ‘계정과목명세서’는 사용자가 지정한 기간부터 잔액을 계산하는 차이점 뿐이다.

화면 우측하단의 [전계정출력]을 클릭하면 계정과목에 등록된 모든 계정을 하나씩 차례로 출력한다. 또한 [증빙없음] 자료는 제외하고 싶으면 하단의 [모든자료]를 클릭하여 [증빙자료]로 바꾼 뒤 출력하면 전표번호가 있는 거래만 출력한다.

먼저 출력할 기간을 설정하고 달력화면 왼쪽에서 출력하려는 계정과목을 찾아 선택한 뒤 [확인] 버튼을 누른다. 한번에 여러 개의 계정을 선택할 수 있는데, 왼쪽 계정과목에서 계정명 앞 빈칸에 마우스로 표시를 만든 뒤, [확인]을 누르면 표시된 계정과목을 하나씩 차례로 화면에 보여주고 출력한다. 한 계정보기(출력)이 끝나면 자동으로 다음 계정에 대한 원장내역을 출력한다.